Děj hry se odehrává pět let po od Call of Duty 4: Modern Warfare. Předchozí konflikt byl zažehnán a hlavní nepřítel a terorista Imran Zakhaev přišel o život. Jenže podobných zločinců pobíhá po světě stále dost a tak na Zakhaevovo místo nastupuje Vladimir Makarov, který by chtěl docílit likvidaci USA i za cenu atomové války. Je tedy na vašich hrdinech ze speciálních jednotek, aby se novému zlu postavili a zabránili nejhoršímu, jenže ne všem se při plnění jejich úkolů podaří přežít. *Arduška*